「思い出して、翅（はね）があったころのことを」 1万2千年前の想いに応え、繋がったのは欠けたこころ。 太陽と月と火星が出会うとき、新たな合体の調べが流れる──！ 湘南の海に浮かぶ小島、江の島。 美しくのどかなその浜辺に、〈私立江ノ島学園〉はある。 学園には、全国から優秀な子どもが集められ、 最新の機器を使った英才教育が施されていた。 特殊強化クラスの生徒〈エレメント〉に選ばれたサッコ、リミヤ、トシは、 感情の力で動く戦闘機〈ベクターマシン〉の操縦を命じられ、 謎の侵略兵器〈神話獣〉との戦いを余儀なくされる。 戦いのさなか、不可思議なヴィジョンに導かれ、サッコは叫ぶ──。 「想星合体！ GO、アクエリオン！」 繰り返される輪廻の果てに、現れた機械天翅アクエリオン。 宿命を背負った少年少女は、 得体のしれない団体〈宇宙たまごの会〉や大人たちの思惑が交錯する中、 この宇宙の真実と向き合っていくことになる……。 これは、おのれの感情と宇宙の存亡を賭けて紡がれる、壮大な愛の神話。
三年前，云青岩从凡人界意外坠入仙界。三千年后，他成为叱咤仙界的云帝。破开虚空，回到凡人界的云青岩发现这里的时间只过了三年。 “曾经，我没有实力守护心爱之人
外表像女孩子一样可爱的二鸟修一（畠山航辅 配音）常常遭到同龄男生的欺负和嘲笑，和女生却相处的分外融洽，长此以往，修一生出了“想成为女孩子”的念头。与此同时，女生高槻佳乃（瀬戸麻沙美 配音）因其帅气的外表被赋予了“老弟”的外号，但其实佳乃有着意外柔软和脆弱的内心，“如果真的能够成为男孩子就好了”，佳乃是这样想的。一次偶然中，就是这样的两个人，他们相遇了。 在偏远的小镇，远走高飞的两人过起了交换身份的生活。在最初梦想达成的快乐过去后，越来越多的问题和麻烦渐渐浮出水面，被身份和性别困扰着的两人，能否在互相的支持和照应之下找到自己真正想过的生活呢？
