在播磨,武藏一行遇见了上杉龙臣统领的大型武士团——上杉武士团。他们的目的是讨伐盘踞在淡路岛的巨大鬼神“炮战龙八岐大蛇”。在那里,还有武田尚虎率领的武田武士团,与武藏同龄的武士岛津秋弘、尼子胜巳,以及稍显不通世俗的腼腆公主猿渡满等人。 在各种想法翻涌的涡旋之中,武藏一行也加入了灭鬼的战斗。而他们要挑战的八岐大蛇,则是号称“从未被人伤及分毫”、铜墙铁壁般的鬼神。武藏和同伴们将要面对的,是一场前所未有的激战。
位于南洋腹地的一个无名小岛,隐藏着一个科技发达的实验室。实验室中,一个未知的生命正在孕育。此前不久,疯狂的科学家们在某个远古遗迹提取到了最强宝可梦梦幻的基因,随后利用现代科技,提供基因提升改造,人工创造了无可匹敌的宝可梦——超梦。超梦诞生之初,对自己的命运倍感困惑,旋即暴走。但是一个心怀叵测的男人出现,用花言巧语哄骗了超梦,使其和自己联手操控世界。然而无论打败多少对手,超梦仍然充满困惑,不知自己是谁,为何拼命战斗,又为何降生于世。 当他的困扰达到顶点之际,超梦再度暴走,回到了当初诞生的小岛,心中充满了无限的憎恨……