上一部结尾，尼奥（基奴李维斯 饰）终于意识到自己的能力和使命，中弹复活后，变成了无所不能的“救世主”，他和女友崔妮蒂（凯莉·安·摩丝 饰），舰长墨菲斯（劳伦斯·菲什伯恩 饰）回到了人类的基地锡安，受到人们的热烈欢迎。此时，“母体”决定先下手为强，派出了两万五千只电子乌贼攻击锡安基地；墨菲斯、尼奥和崔妮蒂则再次进入“母体”，寻找“制钥者”，准备从内部破坏；而本该被尼奥消灭的特勤史密斯似乎出了点问题，脱离了“母体”的控制，拥有可怕的复制能力，阻碍尼奥他们的行动。

故事的设定发生在当下，变种人族群遭到了前所未有的毁灭性打击，而这一切的根源是“魔形女”瑞文（詹妮弗·劳伦斯 Jennifer Lawrence 饰）在1973年刺杀了玻利瓦尔·特拉斯克（彼特·丁拉基 Peter Dinklage 饰）。在得知“幻影猫”（艾伦·佩吉 E llen Page 饰）利用穿越时空的能力帮助Blink（范冰冰 饰）等战友逃脱巨型机器人“哨兵”的追杀后，X教授（帕特里克·斯图尔特 Patrick Stewart 饰）和万磁王（伊恩·麦克莱恩 Ian McKellen 饰）达成认同，决定让金刚狼（休·杰克曼 Hugh Jackman 饰）穿越回1973年，找到年轻的X教授（詹姆斯·麦卡沃伊 James McAvoy 饰）和年轻的万磁王（迈克尔·法斯宾德 Michael Fassbender 饰）并说服他们一起阻止魔形女的行动。于是，金刚狼踏上了回到过去的旅程，但是命运会不会发生逆转，任何人都无从知晓。

地球正遭受库尔库斯（Kulkus）的攻击，库尔库斯是一个充满敌意的外星种族，感染了一种致命病毒，需要人类血液来研制解毒剂。世界各国政府与人形大使谈判，达成和平协议，将八百万人类（各国共享）赠予外星人，作为回报，外星人将拯救我们的星球。科学家斯蒂芬·蔡斯的女儿希瑟·蔡斯被选中，她的父亲为了拯救她而战，加入了抵抗军。他向抵抗军领袖布莱尔和亚历克斯提议，将他的研究成果与1947年发现的一些外星物质交换，以换取女儿的自由。但希瑟是一个特殊的种族，拥有治愈外星人的基因，因此外星人拒绝释放她。作者：克劳迪奥·卡瓦略，巴西里约热内卢

本片根据一桩真实事件改编。在1975年11月5日晚上，在亚利桑那州的荒野山林中，五位伐木工人宣称亲眼目睹他们的同伴崔维斯（DB史威尼饰）被天外幽浮给绑架了。镇上居民认为他们头脑有问题，当地警长（詹姆斯嘉纳饰）则认为他们是在掩饰一桩命案，这种说法是要妨碍警方调查。然而，事情的真相自然唯有当事...

充满无限未知的疯狂多元宇宙即将展开，一切皆有可能。

FBI特工乔（杰弗里·迪恩·摩根 Jeffrey Dean Morgan 饰）和搭档凯瑟琳（艾比·考尼什 Abbie Cornish 饰）正在调查一宗连环杀人案，此案件手段之凶残，逻辑之混乱让两名探员感到无从下手。无奈之下，他们找到了隐居多年的通灵神探约翰（安东尼·霍普金斯 Anthony Hopkins 饰），希望借助他的特异功能找到有用的线索。                                                                      　　然而，案件的凶手似乎知道了约翰的重出江湖，他不仅毫不顾忌的再度犯案，还留下了充满挑衅意味的字条。随着调查的深入，约翰逐渐发现，凶手竟然和他一样拥有通灵能力，而和他相比，自己一方显然落入了下风，丝毫没有翻身的机会。就在约翰一行人走投无路之时，凶手竟然主动献出了真身。

决战日当天，红皇后和白皇后的军队开战，以决定仙境的命运。白皇后派出预言中的勇士爱丽丝，爱丽丝鼓起勇气，手持佛盘剑面对炸脖龙的挑战。红皇后派出终极法宝炸脖龙，与爱丽丝决一死战。预言中的爱丽丝斩杀炸脖龙，爱丽丝凭着信心和佛盘剑完成了这一历史使命。爱丽丝在跟炸脖龙搏斗的时候，她明白了，她父亲每天早上会想明白六件不同的事，她也明白，人会变大会小，兔子会说话，猫会笑，是一个地方叫仙境，最重要的是“我能杀死炸脖龙”。爱丽丝悟出了真我与自信，相信自己一定能成功，鼓起勇气，手持佛盘剑打败了炸脖龙，砍下了炸脖龙的头，炸脖龙一死，红皇后的战士们失去了精神支柱，全部倒戈离她而去。白皇后重新成为仙境的王，她把红皇后和黑骑士永远逐出仙境。

一群米斯卡顿大学的年轻科学家发明了一个时间机器，最终发现他们被来自另一个维度的神秘的、看不见的力量操纵着。

一群甲午战争的幸存者聚集在一个山谷里，却遭到拥有心灵感应能力的食人变种人的威胁。他们争吵不休，抱怨连连，但这对他们的处境并没有什么帮助。